人工RNA分子により動的な遺伝子発現制御を実現する「非組換えRNA技術」体系の構築

遠藤 慧
(京都大学iPS細胞研究所 初期化機構研究部門 特定研究員) ※現職 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻 生命分子遺伝学分野 助教

個人ウェブサイト: https://goo.gl/MJhsCQ

2015年8月4日火曜日

和文総説と原著論文が発表されました




最近 2 報の論文が発表されました。


1. 和文総説(細胞工学)


1 報はもう 2 週間前のことなのですが、現在の所属での和文総説が細胞工学(秀潤社)の8月号に掲載されました。

  真核生物のtRNA分子擬態複合体による遺伝暗号解読機構
   伊藤耕一、和田美紀、遠藤慧
 細胞工学, 34 (8): 745–749. (2015)

我々の研究室の研究内容(のごく一部ではありますが…)を日本語で解説した総説論文が発表される機会はそんなに多くはないと思いますので、特に大学院進学を考えている学部生の皆さんにはちょうどよいのではないかと思います。

ところで、この細胞工学8月号ですが、偶然にも前所属の齊藤先生(と藤田先生)も寄稿されていました。研究者の世間はなんだか狭いものだなぁ、と感じました。

  翻訳制御の合成生成物学
   藤田祥彦、齊藤博英
   細胞工学, 34 (8): 783–789. (2015)

現所属にはまだ半年ちょっとくらいですので、私のこれまでの研究成果はむしろこちらの総説で解説していただいています。是非ご覧ください。


2. 原著論文 (Nature Biotechnology)


もう 1 報は原著論文で、米国 MIT の Ron Weiss 教授らの研究グループとの共同研究の成果が Nature Biotechnology のオンライン版に公開されました。

  Mammalian synthetic circuits with RNA binding proteins for RNA-only delivery.
   Wroblewska, L., Kitada, T.*, Endo, K.*, Siciliano, V., Stillo, B.,
     Saito, H. and Weiss, R. (*equal contribution)
   Nature Biotechnology, in press. doi:10.1038/nbt.3301
   論文へのリンク(Nature Biotechnology)

私たち生き物がそもそも持っている遺伝子の仕組みや、当然それに基づいた従来の遺伝子工学では、「DNA」と「転写レベルの制御」によって遺伝子同士のネットワークが構成されています。一方、今回公開された論文は「RNA」と「翻訳レベルの制御」で同等のネットワークを再現しようという試みです。今後、特に医療などの応用分野において、高次元の遺伝子ネットワークを人為的に作成して利用することを視野に入れたときに、今回の論文のような、言わば『非組み替えRNA技術』の概念がきっとトレンドになるものだと信じています。

この論文のキーコンセプトは私が前所属の京都大学 iPS 細胞研究所に移ったときから目指していたもので、一時は自分の力だけではインパクトのある研究論文として成立させることはできないだろうとあきらめていたのですが、同様のコンセプトで研究していた米国 MIT の Ron Weiss 教授らのグループとうまくお互いに補完し合える形で共同研究を実施することができました。というわけで、この研究論文の著者の一人になれたことをとても光栄に思いますし、定期的なオンライン会議をはじめ米国の研究グループとの共同研究の過程では非常に貴重な経験をすることができました。

ところで、この論文の 2 番目の著者は MIT でポスドクをされている日本人の方なのですが、実はなんと私の学部生時代の1コ後輩でした。研究者の世間はなんだか狭いものだなぁと、つくづく感じました。

2015年6月26日金曜日

学部学生の学生実験




東京大学の教養学部1、2年生(理科)向けに

柏キャンパスサイエンスキャンプ

なるものが開催されます。先ほど知ったのですが、今日の夕方(6限)と来週火曜日の夕方(6限)にプレガイダンスが行われるようです。興味のある方は参加してみてはいかがでしょうか。

実は今回、我々の研究室も参加しています。日程はまだまだ先の話になりますが、来年2月2日からの3泊4日です。この日程での正規のガイダンスは9月25日に開催されるようですね。

柏キャンパスサイエンスキャンプ IV
(6) メディカル情報生命専攻 生命分子遺伝学 伊藤耕一 教授
  遺伝子の発現をコントロールするスイッチをつくろう

なんと3泊4日の宿泊費は大学負担らしいです。1日だけだと移動も大変なうえに、あまりキャンパスに滞在する時間もとれないでしょうから、柏キャンパスをある程度まとまった期間で体験でできる素晴らしい機会じゃないかと思います。思い起こせば十数年前、私の教養学部生時代にもいくつかの実習に参加しました。日帰りでしたが地質の実習で伊豆大島や三浦半島に行ったり、三崎の臨海実験所に1泊の実験に参加したり。そういえば伊豆大島は船中一泊だったような。普段同じキャンパスにいながら、なかなか新しい人と知り合う機会もないと思うので、知り合いの輪を広げるチャンスでもあったと思います。


ちなみに先週の後半から学部学生の実験を少し手伝う機会がありました。先週は2日間それぞれ半日で、しばらく間があいて今日の午後 30 分くらいです。わずかな時間だけでしたが、学部生のいない部局にいる私にとっては貴重な経験で、昨年の「やさしい科学技術セミナー」依頼くらいでしょうか。いや、さすがに中学生と学部生を一緒に扱っちゃダメですね。

手つきなどもたどたどしくて、実は、実験は本当に大丈夫なのかな…などと思っていたのですが、侮るなかれ結果は立派なものでした。今回の経験が彼らの将来に少しでも役に立ってくれれば光栄です。さらに欲を言えば、我々の研究に少しでも興味を持ってもらえるとうれしいのですが、、、とにかくお疲れ様でした!

2015年5月22日金曜日

論文が公開されました




先日のブログで少し触れていましたが、主に前職の京大 iPS 細胞研究所 (CiRA) で携わっていた研究成果について、本日、論文がオンライン公開されました。


doi:10.1016/j.stem.2015.04.005
論文本文へのリンク (Science Direct)

雑誌の方には6月号での発表になる予定だと思います。この論文は、山中先生・吉田先生のグループと CiRA 研究所内での共同研究でした。著者がものすごく多いですので、それなりに大きな研究プロジェクトと言えるのかもしれませんね。一応、私は共同筆頭著者の一人として参加しています。私はもともと再生医療や幹細胞の研究とは全く縁のない mRNA の研究に携わっていました。幸運にも iPS 細胞研究所に参加する機会を得て、そのときから、再生医療・細胞療法を中心とした医療の分野で、試験管内で合成した人工の mRNA 分子をどうにか有効利用して役立てられないだろうか、と思って研究を進めてきました。今回はその研究成果の第一歩という感じで、うれしい限りです。

今回の論文が掲載される Cell Stem Cell という論文誌は、Cell Press という生物系の論文を専門に扱う結構メジャーな出版社から発行されている幹細胞関連の研究に特化した論文雑誌です。お恥ずかしながら CiRA に所属するまでは存在を知りませんでした……今回の論文は、そのなかでも Resource という Cell Press に特有の、新しい材料・方法・解析データなどを特に取り扱う論文形式でした。記事の形式も投稿プロセスも一般の論文(Article)と何も違いがないので、わざわざ記事のタイプを分類しなくてもいいんじゃないかな、とも思いますが、ある程度の分類がなされていた方が読者にはわかりやすい、ということなのかもしれないです。

CiRA のウェブサイトでは一般向けに日本語で解説されているので、きっと論文を読まなくても、あるいは分野外の方にとってもわかりやすいのではないかと思いますので、こちらも紹介してしまいます。


マイクロRNAをつかった細胞の選別方法の開発 ~高純度な心筋細胞の作製に成功~(京都大学 iPS細胞研究所


さらに、なんと日経新聞などのメディアでも紹介されたようです。

iPS由来の細胞選別、種類別に正しく 京大が新手法(日経新聞)


せっかくの機会ですので近所のコンビニまで日経新聞を買いにいきました。午後だったせいか、もう一部しか残ってなかったですが、無事に新聞ゲットできました。

2015年4月1日水曜日

新年度

新年度になりました。先ほど確認したら、無事、専攻のウェブページが更新されているようでした。

東京大学 大学院 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻

本日から発足となります。今週土曜日のシンポジウム・大学院説明会にも是非お越し下さい。

新専攻に入学された一期生の皆さんは今後ともよろしくお願いします。


私の近況ですが、前所属の京都大学 iPS 細胞研究所での研究論文が受理されました。きっと近いうちに公開されることだと思います。そのときにはきっと詳細も報告できると思います。うれしいニュースが続いて本当に幸せなことです。

2015年3月24日火曜日

新専攻発足

今年度もあとわずかになってしまいました。毎年この時期の恒例ではありますが、1年経つのは早いもので、今年度もあっという間だったように感じます。

今年度は、春の Japan Prize の授賞式と晩餐会、秋の京都から現所属への異動を筆頭に、これまでの人生でもかなり多くのイベントがあった一年でした。その締めくくり (?) として、つい数日前、待望の子どもが誕生しました。初めてのことばかりなので戸惑うことも多いですが、そしてこれからはもっともっと多くなるんでしょうけど、小さなことでも大変なことでも楽しんで取り組めたらいいですよね。ある意味では研究にも通ずるところがあるような気もします。もちろんお仕事にもますます力が入ります。


さてさてそんなお仕事について。まだ異動してから半年も経っていないのですが、また所属が変わります。といっても別の場所に移るというわけではなく、現在所属している専攻が合併して新しい専攻に生まれ変わります。

その名も、

東京大学大学院 新領域創成科学研究科

メディカル情報生命専攻


です。

詳細はウェブページで! URL: http://www.cbms.k.u-tokyo.ac.jp

っとバシっと決めたいところなのですが、詳細な情報は年度があけて4月1日に更新のようです。きっとエイプリルフールではないはずですので、信じましょう。現在でも新専攻のキックオフシンポジウムと大学院説明会のポスターが掲載されていますので、興味のある方は上記ページを要チェックです。

キックオフシンポジウムも大学院説明会も4月4日東京大学 本郷キャンパスで開催されます。これからの医科学と情報科学の融合へ向けた新専攻ですので、こういった分野に興味のある方は、大学院の進学希望者に限らず、どしどしご参加ください。

キックオフシンポジウム
日時:4月4日(土)13:00
場所:東京大学伊藤国際学術研究センター 伊藤謝恩ホール

入試説明会
日時:4月4日(土)10:00
場所:東京大学伊藤国際学術研究センター 伊藤謝恩ホール

、、、場所は赤門の近くにわりと最近できたところでしょうか?本郷キャンパスにはほとんど行かないので、たまに行くと浦島太郎な気分を味わえます。

ポスターを見ていただくとわかりますが、大学院の説明会は5回ほど開催が予定され、そのうち2度かはラボへの見学ツアーもあります。専攻に興味のある方はもちろんですが、私たちの研究室で一緒に研究したい、とちょっとでも興味を持った方、お待ちしています。

最後の方、ほとんど宣伝になってしまいましたね。